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一、来源有一。
1、源于官位，出自周朝时期官吏巫马，属于以官职称谓为氏。
在周朝的官职体制中，有一种专门掌管养马并为马治病的官员，称为巫马，也就是马医官，隶属于夏官府司管辖。在典籍《周礼·夏官》中记载：“巫马掌养疾马而乘之治，相医而药，攻马疾。”乘，就是将病马驱赶使之奔跑起来，根据病马的奔步情形判断其病因，然后再对症施治。这在史籍《姓氏考略》中也有记载：“巫马掌养疾马而乘治之，以官为氏”。
在巫马官的后裔子孙中，有以先祖官职称谓为姓氏者，称巫马氏，后又有省文简改为单姓巫氏、马氏者，巫马氏复姓族人越来越少了，不过，皆世代相传至今。
二、迁徙分布，聚集地
巫马氏复姓或是典型的古老汉族姓氏，但人口总数在中国的大陆和台湾省均未列入百家姓前三百位，在宋版《百家姓》中排序为第四百四十八位门阀。巫马姓在大陆和台湾都没有列入百家姓前一百位。巫马氏望族居单父（今山东省单县）、鲁郡（西汉时置鲁国，三国魏及晋代改为鲁郡。相当于现在的山东省曲阜一带）。
今广西壮族自治区、河北省邯郸市有少量巫马氏族人分布
三、郡望堂号
郡望
鲁郡：亦称鲁国、鲁国郡。
单父县：春秋时期为鲁国单父邑。秦朝事情置单父县，属砀郡。西汉时期单父县属山阳郡，又别置平乐县，亦属山阳郡。
堂号
鲁郡堂：以国立堂，亦称鲁国堂。()
单父堂：以望立堂。